特点不同：遗传物质的基本特性：相对的稳定性，能自我复制，前后代保持一定的连续性并能产生可遗传的变异。基因特点：基因能够“突变”，突变大绝大多数会导致疾病，另外的一小部分是非致病突变。非致病突变给自然选择带来了原始材料，使生物可以在自然选择中被选择出最适合自然的个体。

含义不同

遗传物质：亲代与子代之间传递遗传信息的物质．除一部分病毒的遗传物质是RNA外，其余的病毒以及全部具典型细胞结构的生物的遗传物质都是DNA。这种物质是染色体的主要成分。

基因遗传信息的基本单位。一般指位于染色体上编码一个特定功能产物（如蛋白质或RNA分子等）的一段核苷酸序列。